Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TMPOP42166 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TMPOP42166 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TMPOP42166 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TMPOP42166 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TMPOP42166 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TMPOP42166 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms