Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms