Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP18Q9UMW8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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