Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms