Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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UBXN4Q92575 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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UBXN4Q92575 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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UBXN4Q92575 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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UBXN4Q92575 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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