Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
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