Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TWISTNBQ3B726 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TWISTNBQ3B726 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TWISTNBQ3B726 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TWISTNBQ3B726 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TWISTNBQ3B726 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TWISTNBQ3B726 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms