Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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