Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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