Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
TCOF1Q13428 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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TCOF1Q13428 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TCOF1Q13428 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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