Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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NME3Q13232 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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