Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3BQ13214 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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SEMA3BQ13214 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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SEMA3BQ13214 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3BQ13214 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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