Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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