Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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