Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms