Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP29Q9HBJ7 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
USP29Q9HBJ7 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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