Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TM6SF1Q9BZW5 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TM6SF1Q9BZW5 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TM6SF1Q9BZW5 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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