Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NCF4Q15080 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NCF4Q15080 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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