Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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