Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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