Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TDP1Q9NUW8 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TDP1Q9NUW8 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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TDP1Q9NUW8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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TDP1Q9NUW8 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TDP1Q9NUW8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TDP1Q9NUW8 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TDP1Q9NUW8 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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