Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms