Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms