Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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RUNX3Q13761 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX3Q13761 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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