Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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