Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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