Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ADGRE1-204ENST00000381407 2687 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
FOXC1Q12948 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 FLJ31356-202ENST00000445878 3001 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AL357055.3-201ENST00000421157 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXC1Q12948 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms