Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms