Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTL8BQ17RB0 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms