Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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NRF1Q16656 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NRF1Q16656 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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