Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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ECM1Q16610 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ECM1Q16610 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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