Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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ITGB3BPQ13352 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ITGB3BPQ13352 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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