Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXD4Q12950 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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