Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ACADSBP45954 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACADSBP45954 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms