Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms