Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC93Q567U6 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC93Q567U6 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC93Q567U6 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC93Q567U6 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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