Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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SS18Q15532 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SS18Q15532 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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