Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
DUSP4Q13115 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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