Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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