Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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