Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ZNF548Q8NEK5 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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ZNF548Q8NEK5 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ZNF548Q8NEK5 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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