Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CAVIN4Q5BKX8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms