Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms