Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTP4A2Q12974 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTP4A2Q12974 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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