Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPS29P62273 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms