Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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PTPRBP23467 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPRBP23467 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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