Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP35Q9P2H5 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP35Q9P2H5 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP35Q9P2H5 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP35Q9P2H5 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP35Q9P2H5 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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