Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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