Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms