Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LAMA3Q16787 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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